Atualmente possui 3 espaços musealizados, sendo um a céu aberto, o na antiga estação ferroviária de Peirópolis e uma mostra no hall da sede do Complexo Cultural e Científico de Peirópolis CCCP.
Nelas pode-se observar: réplicas em esqueleto, reconstruções em vida, cenários, dioramas, além de um acervo bastante representativo de fósseis dos diversos componentes da biota desta região, em especial os dinossauros.
Para melhor atendimento, o museu oferece mediadores treinados para dar explicações e esclarecer dúvidas.